Việc sửa đổi Luật Thuế giá trị gia tăng nhằm hoàn thiện quy định về chính sách thuế GTGT, bảo đảm tính minh bạch, dễ hiểu, dễ thực hiện, góp phần nâng cao năng lực và hiệu quả của hoạt động quản lý thuế trong phòng, chống trốn thuế, thất thu và nợ thuế; bảo đảm thu đúng, thu đủ vào ngân sách nhà nước, bảo đảm ổn định nguồn thu ngân sách Nhà nước. Đặc biệt, việc áp dụng thuế suất 5% đối với phân bón thay vì miễn thuế giá trị gia tăng là một bước đi cần thiết để tạo sự công bằng giữa sản phẩm trong nước và nhập khẩu.